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馬鈴薯貯藏期間引起塊莖損耗的因素主要有塊莖本身的生理因素，如呼吸、蒸發(fā)、發(fā)芽等；另一方面是病蟲(chóng)害引起的損耗。
（1）塊莖的呼吸損耗塊莖通過(guò)皮孔吸收貯藏庫(kù)中的氧氣進(jìn)行呼吸，轉(zhuǎn)化塊莖中的碳水化合物，放出二氧化碳，并釋放熱量。影響呼吸強(qiáng)度的主要因素是溫度，溫度增高，則呼吸增強(qiáng)，塊莖損耗增加；影響呼吸強(qiáng)度的還有塊莖的成熟度、損傷等因素，受損傷、未成熟的塊莖，以及發(fā)芽的塊莖都有較強(qiáng)的呼吸作用。由于塊莖的呼吸損耗，可減少重量6.5％～ll％。
（2）蒸發(fā)損耗馬鈴薯塊莖中的水分含量約為80％～85％，貯藏期間的損耗，除碳水化合物通過(guò)塊莖的呼吸作用損耗外，主要的重量損失是塊莖內(nèi)的水分。塊莖受傷會(huì)引起大量失水，貯藏庫(kù)中的濕度低于85％，也會(huì)加速塊莖中水分的蒸發(fā)。一般情況下，貯藏的第一個(gè)月塊莖失水量約為鮮重的1.5％，以后為 0.5％～l％。
（3）發(fā)芽損失貯藏的塊莖達(dá)3個(gè)月以上，則休眠期結(jié)束，如貯藏溫度高于5℃，則會(huì)發(fā)芽。隨著貯藏溫度、濕度的增加，幼芽生長(zhǎng)速度加快，呼吸增強(qiáng)，塊莖中的碳水化合物大量轉(zhuǎn)化成能量而消耗。發(fā)芽的馬鈴薯一晝夜內(nèi)重量要損失0.05％～
0.07％，嚴(yán)重時(shí)塊莖大量失水而皺縮，重量損失是巨大的。如要抑制發(fā)芽，一是將貯藏溫度控制在2～4℃；或利用抑芽劑；光照能減慢芽的生長(zhǎng)，甚至抑制芽的伸長(zhǎng)，利用散射光貯藏種薯是一種有效的方法。
（4）病蟲(chóng)害引起的損失塊莖貯藏期間由于病蟲(chóng)害引起的大量爛薯是最大的損耗。貯藏期間濕度較大時(shí)，引起塊莖軟腐的主要病原有青枯病、環(huán)腐病、晚疫病和黑脛病等。濕度較小時(shí)，引起干腐的病原有鐮刀菌于腐病、粉痂病等。為減少病害導(dǎo)致的爛薯，應(yīng)創(chuàng)造良好的通風(fēng)條件，保持塊莖的薯皮干爽；以及3～ 4℃的低溫條件，可降低病害的發(fā)生與擴(kuò)展蔓延。 貯藏期間的主要蟲(chóng)害是引起塊莖嚴(yán)重?fù)p害的馬鈴薯塊莖蛾，低于l0℃貯藏，塊莖蛾活動(dòng)困難，減少危害和損失。 
