組織培養(yǎng)是否成功，在很大程度上取決于對培養(yǎng)基的選擇。不同培養(yǎng)基有不同特點，適合于不同的植物種類和接種材料。開展組織培養(yǎng)活動時，應(yīng)對各種培養(yǎng)基進(jìn)行了解和分析，以便能從中選擇使用。
培養(yǎng)基中的激素種類和數(shù)量，隨著不同培養(yǎng)階段和不同材料而有變化，因此各配方中均不列入。幾種常用培養(yǎng)基如下：
MS培養(yǎng)基。 MS培養(yǎng)基是目前普遍使用的培養(yǎng)基。它有較高的無機鹽濃度，對保證組織生長所需的礦質(zhì)營養(yǎng)和加速愈傷組織的生長十分有利。由于配方中的離子濃度高，在配制、貯存、消毒等過程中，即使有些成分略有出入，也不致影響離子間的平衡。MS固體培養(yǎng)基可用來誘導(dǎo)愈傷組織，或用于胚、莖段、莖尖及花藥培養(yǎng)，它的液體培養(yǎng)基用于細(xì)胞懸浮培養(yǎng)時能獲得明顯成功。這種培養(yǎng)基中的無機養(yǎng)分的數(shù)量和比例比較合適，足以滿足植物細(xì)胞在營養(yǎng)上和生理上的需要。因此，一般情況下，無須再添加氨基酸、酪蛋白水解物、酵母提取物及椰子汁等有機附加成分。與其它培養(yǎng)基的基本成分相比，MS培養(yǎng)基中的硝酸鹽、鉀和銨的含量高，這是它的明顯特點。
B5培養(yǎng)基。B5培養(yǎng)基的主要特點是含有較低的銨，這是因為銨可能對不少培養(yǎng)物的生長有抑制作用。經(jīng)過試驗發(fā)現(xiàn)，有些植物的愈傷組織和懸浮培養(yǎng)物在MS培養(yǎng)基上生長得比B5培養(yǎng)基上要好，而另一些植物，在B5培養(yǎng)基上更適宜。
N6培養(yǎng)基。N6培養(yǎng)基特別適合于禾谷類植物的花藥和花粉培養(yǎng)，在國內(nèi)外得到廣泛應(yīng)用。在組織培養(yǎng)中，經(jīng)常采用的還有懷特（While，1963）培養(yǎng)基、尼許（Nitsch，1951）培養(yǎng)基等。它們在基本成分上大同小異。懷特培養(yǎng)基由于無機鹽的數(shù)量比較低，更適合木本植物的組織培養(yǎng)。