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cDNA第一鏈的合成

放大字體  縮小字體 發(fā)布日期:2006-07-01

通過(guò)體外無(wú)細(xì)胞系統(tǒng)翻譯找出目的基因mRNA以后,變可進(jìn)行cDNA第一鏈的合成,其步驟包括:

1)在Ependorf管中加50pmol/L的一種α32PdNTP和1mg/ml的mRNA 10μl(10μg),100m mol/L甲基氫氧化汞1μl,室溫反應(yīng)l0分鐘,使RNA變性。
2)加100m mol/L的β-巰基乙醇2μl和10m mol/L RNA酶抑制劑2μl,室溫放置5分鐘。β-巰基乙醇有穩(wěn)定逆轉(zhuǎn)錄酶活性的作用。
3)向上述反應(yīng)混合物加lmg/ml的引物01igo dT(12~18聚體)10μl,1mol/L Tris.HCl(pH8.3)5μl,11mol/L KCl7μl,250m mol/L MgCl22μl,再加20 m mol/L的4種dNTP各2.5μl,逆轉(zhuǎn)錄酶2μl(40單位),用水補(bǔ)充到50μl,充分混勻,42℃反應(yīng)1~3小時(shí)。
4)加0.5 EDTA(pH8.0)2μl終止反應(yīng),然后加150m mol/L NaOH 25μl,65℃反應(yīng)1小時(shí),或37℃8小時(shí),水解mRNA模板,得到cDNA第一鏈,再加pH8.0,1m mol/L Tris.HCl,各25μl中和其pH。
5)測(cè)定放射活性,計(jì)算合成的DNA量。實(shí)際上,cDNA第一鏈的產(chǎn)量往往不會(huì)超過(guò)poltAmRNA用量的10%~30%。
6)用等體積的酚-氯仿抽提—次,取水相并用SephadexG-100離心柱層析(參看第6章)將cDNA同剩余的dNTP分開(kāi),以2.5倍體積的95%冷乙醇沉淀。
7)合成的cDNA第—鏈在1.4%的堿性瓊脂糖凝膠上電泳,用末端標(biāo)記的pBR322限制性片段為分子量標(biāo)準(zhǔn),電泳后,鋪X-光片,進(jìn)行放射自顯影,確定cDNA第一鏈的大小。

 

 

 
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