根據(jù)《外國公司船舶運(yùn)輸收人征稅辦法》(財稅字[1996]087)(以下簡稱《征稅辦法》)的規(guī)定，外國公司以船舶從中國港團(tuán)運(yùn)藏旅客、貨物或者郵件出境的，所取得的運(yùn)輸收人、所得應(yīng)在中由進(jìn)行納稅。取得運(yùn)輸收入的承運(yùn)人為納稅人．包話實(shí)方派船的期租船，以外國公司為納稅人；承租船，以外國由東為納稅人；中國租用外國籍船舶再以期租方式轉(zhuǎn)租給外國公司的，以外國司為納稅人；外國公司期租的中國籍船舶，以外國公司為納稅人，其他外國籍船舷，以其船公司為納稅人。繳納的營業(yè)稅為收人總額的3％，企業(yè)所得稅為收入總額的1.65%。
為了進(jìn)一步加強(qiáng)和完善外國司船舶運(yùn)輸收入的稅收管理以及國際海運(yùn)業(yè)對外支付管理，國家稅務(wù)總局、自家外匯管理局2001年12月4日發(fā)布了《關(guān)于加強(qiáng)外國公司船舶運(yùn)輸收入稅收管理及國際海運(yùn)業(yè)對外支付管理的通知》(國稅發(fā)[2001]139號)(以下簡稱《通知》。該通知自2002年5點(diǎn)1日起執(zhí)行。
(通知)規(guī)定，負(fù)責(zé)向取得船舶運(yùn)輸收入的外國公司直接或間接支付運(yùn)費(fèi)的單位或個人為外國公司應(yīng)納稅款的扣繳義務(wù)人，包括外商獨(dú)資船務(wù)公司、國家船舶代理公司、國際貨運(yùn)代理公司、以及其他對外支付國際海運(yùn)運(yùn)費(fèi)的單位或個人�？劾U義務(wù)人在每次對外支付運(yùn)費(fèi)前，以對外支付運(yùn)費(fèi)總額為應(yīng)納稅入總額，按照規(guī)定的稅串直接從納稅人的運(yùn)費(fèi)總額中代扣應(yīng)納稅款。同時，扣繳義務(wù)人應(yīng)分別向當(dāng)?shù)刂鞴車叶悇?wù)局報送(代扣代繳外國公司船舶運(yùn)輸收入所得稅報告表)，向地方稅務(wù)局報送(代扣代繳外國公司船舶運(yùn)輸收入營業(yè)稅報告表)。
按照我國同其他田家締結(jié)的避免雙重征稅協(xié)定、互免海運(yùn)企業(yè)國際運(yùn)輸收入?yún)f(xié)定、海運(yùn)協(xié)議以及英他有關(guān)協(xié)議或換文，外國公司可以享受減稅或免稅待遇的，須自行或委托其扣繳義務(wù)人分別向當(dāng)?shù)刂鞴車叶悇?wù)局填報(外國公司船船運(yùn)輸收入免征企業(yè)所得稅證明表)，向當(dāng)?shù)刂鞴艿胤蕉悇?wù)局填報(外國公司船舶運(yùn)輸收人免征營業(yè)稅證朗表)，并提供其他有關(guān)證明文件。末申增免稅或不能提供有關(guān)證明文件的，不得享受免稅待遇。外國公司不能及時提交免稅證明的，應(yīng)先按規(guī)定交稅，待取得免稅證明后再辦理退稅。
扣繳義務(wù)人在國際貿(mào)易出口項(xiàng)下向外國公司支付運(yùn)費(fèi)時，應(yīng)向外匯指定銀行提交完稅憑證或免稅證明。不能按要求提供完稅憑證或免稅證明的，不得對外付匯。根據(jù)《稅牧征收管理法》的規(guī)定，扣繳義務(wù)人應(yīng)扣末扣、應(yīng)收而不收稅款的，由稅務(wù)機(jī)關(guān)向納稅人追繳稅款，對扣繳義務(wù)人處應(yīng)扣末扣、應(yīng)收來收稅款50%以上三倍以下的罰款。
無船承運(yùn)人稅收管理
根據(jù)《國際梅運(yùn)條例》及有關(guān)規(guī)定，中國企業(yè)法人和境外國際船船運(yùn)輸公司在中國境內(nèi)從事無船承遠(yuǎn)業(yè)務(wù)，應(yīng)向交通部提出申請并提交有關(guān)申謂材料，取得《無船承運(yùn)業(yè)務(wù)經(jīng)營資格登記證》。《國家稅務(wù)總局關(guān)于從事國際海運(yùn)無船承運(yùn)業(yè)務(wù)使用發(fā)票有關(guān)問題的通知》(國稅函[2002]404號)規(guī)定，在中國境內(nèi)注冊，并依法取得交通部(無船承運(yùn)業(yè)務(wù)經(jīng)營資格登記證)的企業(yè)，可以向稅務(wù)機(jī)關(guān)申謂辦理領(lǐng)購、使用《國際海運(yùn)業(yè)運(yùn)輸專用發(fā)票》事宜、領(lǐng)購、使用《國際海運(yùn)業(yè)運(yùn)輸專用發(fā)票》。
對于從事無船承運(yùn)業(yè)務(wù)取得的收入是按營業(yè)稅交通運(yùn)輸業(yè)稅目(稅率為3％)交稅還是按營業(yè)稅服務(wù)業(yè)錦目(稅率為5%)交稅的問題，一時成為人們爭論的焦點(diǎn)。
認(rèn)為應(yīng)按交通運(yùn)輸業(yè)稅目交稅的人認(rèn)為，從事無船承運(yùn)業(yè)務(wù)的企業(yè)是以承運(yùn)人身份接受托運(yùn)人的貸載，簽發(fā)自己的提單或運(yùn)輸證，向托運(yùn)人收取運(yùn)費(fèi)，承擔(dān)承運(yùn)人責(zé)任，從事的是運(yùn)輸經(jīng)營活動。因此，應(yīng)按交通運(yùn)輸業(yè)稅目交稅。
認(rèn)為應(yīng)按服務(wù)業(yè)稅目交稅的人認(rèn)為，交通運(yùn)輸業(yè)是指使用運(yùn)輸工具或人力、畜力將貨物或旅客送達(dá)目的地，使其空間位置得到轉(zhuǎn)移的業(yè)務(wù)活動。雖然無船承運(yùn)人在無船承運(yùn)業(yè)務(wù)中擔(dān)當(dāng)承運(yùn)人的身份，但并沒有從事稅法規(guī)定的運(yùn)輸經(jīng)營活動。無船承運(yùn)人在其經(jīng)營活動中只不過是以自己的名義而不是以承運(yùn)人的名義簽發(fā)提單。其取得的收入雖然稱為運(yùn)費(fèi)，但其實(shí)際所得仍然是提供運(yùn)輸經(jīng)營的組織活動所取得的服務(wù)費(fèi)收入，不管這種牧入是代理性質(zhì)的服務(wù)費(fèi)收入還是其他性質(zhì)的服務(wù)費(fèi)收入。因此，無船承運(yùn)業(yè)務(wù)仍然要按照服務(wù)業(yè)稅目征稅。
隨著貨運(yùn)代理人規(guī)模的不斷增大、實(shí)力的不斷增強(qiáng)，其業(yè)務(wù)范圍也不斷擴(kuò)展。有的貨運(yùn)代理人除從事貸運(yùn)代理業(yè)務(wù)之外，還從事運(yùn)輸、倉儲等經(jīng)營活動。這些經(jīng)營活動雖然都征收營業(yè)稅，但屬于不同的營業(yè)稅稅目，稅率不同。根據(jù)稅法規(guī)定，納稅人兼有不同稅目應(yīng)稅行為的，應(yīng)當(dāng)分別核算不同稅目的營業(yè)額；未分別核算營業(yè)額的，從高適用稅率。因此；貨運(yùn)代理人應(yīng)將各種經(jīng)營活動取得的收入分別核算，避免因會計(jì)處理不當(dāng)而造成多交稅款的結(jié)果。
另外，如果貨運(yùn)代理人從事財產(chǎn)租貨、貨物運(yùn)輸或倉儲保管或等經(jīng)營活動，應(yīng)注意繳納印花稅。租賃機(jī)動車輛、機(jī)械設(shè)備、船舶等的，應(yīng)按財產(chǎn)租賃合同金額的千分之一繳納印花稅。從事貨物運(yùn)輸?shù)�，�?yīng)按貨物運(yùn)輸合同金額的萬分之五繳納印花稅。從事倉儲、保管業(yè)務(wù)的，應(yīng)按倉儲保管合同的干分之一繳納印花稅。對于不開立合同，只開立單據(jù)，或者合同不規(guī)范的，應(yīng)按實(shí)際計(jì)算金額繳納印花稅。