一、申報。保稅貨物在保稅倉庫所在地入境時，貨主或其代理人持下列單證向海關申報：
(1)《進口貨物報關單》一式三份。報關單上須加蓋“保稅貨物”印章并注明貨物存入某地保稅倉庫；
(2)經主管海關核發(fā)的《保稅倉庫登記證書》。辦理《保稅倉庫登記證書》的手續(xù)為：申請建立保稅倉庫的單位經理人，持國家工商行政管理部門核發(fā)的營業(yè)執(zhí)照、填寫的《保稅倉庫申請書》及省以上對外經貿行政管理部門批準經營有關業(yè)務的批件，向主管海關申報，經海關審核并派員實地調查，認為符合條件后，批準建立保稅倉庫并頒發(fā)登記證書；
(3)如進口貨物列入國家商檢機構實施檢驗出口商品種類表的，須提交商檢證書。
保稅貨物如需復運出境報關時，應向海關遞交下列單證：
(1)《出口貨物報關單》一式三份；
(2)原進口時由海關蓋印的《進口貨物報關單》。
二、海關查驗放行。上述單證經入、出境地海關查驗無誤后予以放行，其中，入境時，由海關在《進口貨物報關單》上簽章，將二份《進口貨物報關單》隨進口貨物帶交保稅倉庫。保稅倉庫經理人于貨物入庫后，在上述報關單上簽收，一份留存，一份交回海關存查。貨主在保稅倉庫所在地以外的其他口岸進口貨物，應按海關對轉關運輸貨物規(guī)定，辦理轉關運輸手續(xù)，貨物運抵后，再按上述辦法辦理入庫手續(xù)。
說明
(1)貨主在保稅倉庫所在地以外的其他口岸進口貨物，須按海關對轉關運輸貨物的規(guī)定辦理轉關運輸手續(xù)。即由申請人填制由海關統一印制的《轉關運輸貨物準單》，一式三份，加屬國際鐵路聯運貨物，應為貨車裝載清單，也是一式三份，向入境地海關申報并交驗有關貨運單證。海關核準并簽收關封后將加蓋“海關監(jiān)管貨物”戳記并加注關封編號的《海關運輸貨物準單》，連同關封一起交承運人，隨同貨物帶交指運地海關，并按一般貨物的海關手續(xù)填制《進口貨物報關單》，并隨附其他有關單證向海關辦理進口報關。
(2)保稅貨物經批準正式銷售于國內市場時，貨主或其代理人須向海關補辦進口報關手續(xù)并交納關稅和工商統一稅，由海關簽印放行。
(3)對從保稅倉庫中提取來料加工、進料加工備料、貨物，貨主須事先持批準文件、合同等有關單證向海關辦理登記備案手續(xù)，并填寫來料加工或進料加工專用報關單和《保稅倉庫領料核準單》各一式三份，一份由海關留存，一份由領料人留存，一份由海關簽蓋放行章后交還貨主。倉庫經理人憑海關簽印的領料核準單交付有關貨物，并憑領料核準單向海關辦理核銷手續(xù)。
(4)保稅貨物復運出境時，發(fā)貨人或其代理人持《出口貨物報關單》一式三份、保稅貨物進口時由海關簽印的《進口貨物報關單》，向當地海關辦理復運出境手續(xù)。經海關核查與實貨相符后簽印，一份由海關留存，一份發(fā)還給申報人，一份隨貨帶交出境地海關，憑以放行貨物出境。