細(xì)菌分類學(xué)上，腸球菌屬早期并不存在，現(xiàn)今的一些菌種本歸屬于鏈球菌屬,1989年，依據(jù)Facklam和Collins的分類，腸球菌屬內(nèi)包括十二個種及一個變異株，它們是：

　　糞腸球菌（E.faecalis） 屎腸球菌（E.faecium)

　　鳥腸球菌(E.avium) 酪黃腸球菌(E.casseliflavus)

　　堅忍腸球菌(E.durans) 雞腸球菌E.galinarum)

　　芒地腸球菌(E.mundii) 惡臭腸球菌(E.maladoratum)

　　希拉腸球菌(E.hirae) 孤立腸球菌（E.solitarius）

　　棉子糖腸球菌(E.raffinosus) 假鳥腸球菌(E.pseudoavium)

　　糞腸球變異株(E.faecalis var)。

　　糞腸球菌為該屬中最常見的即為代表種。該屬通常指糞便來的可以用氮鈉分離鑒定的一群革蘭氏陽性球菌。由于腸球菌的菌種均含有Lancefield的D群抗原，亦稱D群糞腸球菌或D群腸球菌。腸球菌的DNA G+C含量33%-39%mol。

　　腸球菌普遍存在于自然界，一般棲居在各種溫血和冷血動物的腔腸，甚至昆蟲體內(nèi)，也是健康人體的上呼吸道，口腔或腸道的常居菌。本菌可以引起心內(nèi)膜炎，膽囊炎，腦膜炎，尿路感染及傷口感染等多種疾病。在人類糞便中的數(shù)量僅次于大腸菌群，每克成人的糞便中約含２×10⁸個。由于此污染指示菌比較大腸桿菌對外界環(huán)境溫度適應(yīng)性強(qiáng)、抵抗力強(qiáng)及耐受性強(qiáng)，甚至可以與多種抗生素相抵抗和生長營養(yǎng)要求不高，因此在自然界分布廣，存活力持久。在無糞便污染的環(huán)境中較大腸菌更易發(fā)現(xiàn)，所以，即使檢出腸球菌也沒有糞便污染的指示作用。此外，即使在冷凍，干燥性和經(jīng)中等強(qiáng)度加熱處理的食品中檢出腸球菌也不能提示腸道致病菌的存在，因為腸球菌比沙門氏菌，致病性大腸桿菌抵抗性及存活率均高。

　　食品微生物檢驗主要針對在１０℃和４５℃下可生長發(fā)育的糞腸球菌與屎腸球菌，二者在生化特性、ＤＮＡ雜交結(jié)果有明顯不同。在４５℃條件下，用含疊氮鈉成分的培養(yǎng)基檢測此類指示菌是其主要特征。

　　目前該菌多作為生活飲用水，管道水和一些水質(zhì)的指示菌。衛(wèi)生學(xué)家認(rèn)為，腸球菌類似于大腸菌群的生態(tài)活動，但其對惡劣的外環(huán)境和冷凍條件具有較強(qiáng)的抵抗力，作為監(jiān)測水質(zhì)衛(wèi)生，環(huán)境衛(wèi)生質(zhì)量的污染指標(biāo)更具有衛(wèi)生學(xué)意義。另據(jù)有關(guān)報道，大量的（１０⁹以上）腸球菌可以引起食物中毒，作為一個有衛(wèi)生學(xué)意義的細(xì)菌（該菌的污染在某些食品中也常被發(fā)現(xiàn)），有些國家已經(jīng)制定了針對腸球菌污染限量標(biāo)準(zhǔn)，大多制定在０／克～１０⁵／克范圍內(nèi)。從預(yù)防食物中毒方面，保障人民身體健康考慮，借鑒國外標(biāo)準(zhǔn)，制定適宜的污染限量指標(biāo)，應(yīng)盡快擺到議事日程上來。

１、形態(tài)與染色

　　腸球菌屬的細(xì)菌為革蘭氏陽性球菌，多數(shù)菌種成雙或呈短鏈狀排列；一般無芽胞，無莢膜，少數(shù)菌種有鞭毛，陳舊培養(yǎng)物或在厭氧狀態(tài)下有時呈革蘭氏陰性。

２、培養(yǎng)特性

　　在普通瓊脂及麥康凱瓊脂上形成小菌落，在血瓊脂上形成較鏈球菌稍大的菌落，光滑、較濕潤、易乳化，依據(jù)種的不同，α、β或γ溶血均可出現(xiàn)。在液體培養(yǎng)基中呈均勻渾濁生長，也較易形成長鏈。需氧或兼性厭氧，最適生長溫度37℃，最適pH為4.7-7.6，屬內(nèi)各菌種均能在６.5%氯化鈉肉湯,pH9.6葡萄糖肉湯及４５℃生長，個別菌種在50℃時生長快。

３、抗原結(jié)構(gòu)

　　Lancefied血清系統(tǒng)屬D群，其特異性抗原決定簇是位于細(xì)胞壁中的甘油壁酸，本質(zhì)上是多糖類，含有N-乙酰己糖胺。

４、生化反應(yīng)

　　過氧化氫酶呈陰性，能分解葡萄糖、麥芽糖生成酸，多數(shù)菌株分解甘露醇；膽汁七葉苷水解、萬古霉素敏感性及咯烷基芳基酰胺酶均為陽性；耐一定程度的酸堿、耐鹽和４０％的膽鹽；結(jié)合Ｄ群抗血清進(jìn)行血清學(xué)鑒定可用來區(qū)分腸球菌與鏈球菌，乳球菌屬。依據(jù)甘露醇、山梨醇、山梨糖產(chǎn)酸及精氨酸脫氨基四個關(guān)鍵性的生化生理實驗，可將腸球菌分為三個群。