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siRNA制備方法比較

放大字體  縮小字體 發(fā)布日期:2006-07-06

比較項(xiàng)目

化學(xué)合成

體外轉(zhuǎn)錄

RNase III降解dsRNA

siRNA
表達(dá)載體

PCR
表達(dá)框

材料需求

21-mer RNA
oligos(
一對(duì))

29-mer DNA oligos(一對(duì))

轉(zhuǎn)錄模版 (200-1000bp,兩側(cè)帶T7 啟動(dòng)子)

55-60-mer DNA oligos(一對(duì))

~50-mer DNA oligos(一對(duì))

全部制備/合成時(shí)間所需時(shí)間

4—2

24 小時(shí) DNA oligo合成時(shí)間

1 轉(zhuǎn)錄模版制備時(shí)間

5天以上 DNA oligo合成時(shí)間

~ 6 小時(shí) DNA oligo合成時(shí)間

個(gè)人所需操作時(shí)間

幾乎不需要*

中等

中等

中等

是否需要驗(yàn)證和尋找最有效siRNA

需要

需要

不需要

需要

需要

能否標(biāo)記siRNA (例如用于熒光顯微鏡分析siRNA進(jìn)入細(xì)胞過(guò)程或者在細(xì)胞中的定位)

不能

不能

轉(zhuǎn)染的相對(duì)難易程度

可篩選性 (例如抗生素篩選)

不可以

不可以

不可以

可以

不可以

能否用于長(zhǎng)效抑制

不可以

不可以

不可以

可以(抗生素篩選)

不可以

能否大規(guī)模制備

可以

有限

有限

可以

有限

檢測(cè)總體轉(zhuǎn)染效率

不可以

不可以

不可以

可以

不可以

每個(gè)基因的相對(duì)費(fèi)用(不包含人力)

中等

中等

中等

*取決于合成后是否包含純化、去保護(hù),以及廠家提供的是已經(jīng)退火的即用型雙鏈還是凍干的單鏈

 
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